Farmamundi trabaja con gobiernos e instituciones públicas locales, nacionales e internacionales; organizaciones locales de la sociedad civil; universidades; organizaciones de base comunitaria y comunidades locales.
- Acción Médica Cristiana (AMC)
- Asociación en Pro de la Salud (PROSALUD)
- Acción Internacional para la Salud (AIS)
- Instituto Juan XXIII – Asociación Roncalli
- Colectivo de Mujeres de Matagalpa (CMM)
- Laboratorio de Control de Calidad de Medicamentos de la Universidad Nacional Autónoma de Nicaragua (UNAN) en León
- Ministerio de Salud (MINSA) y los Sistemas Locales de Atención Integral a la Salud (SILAIS)
- Asociación de Servicios Comunitarios de Salud (ASECSA)
- Asociación Servicios para el Desarrollo (SER).
- Médicos Descalzos – Chinique (MeDeS)
- Iniciativa por la Salud y el Desarrollo de las Mujeres (ISDM)
- Observatorio en Salud Reproductiva (OSAR)
- Secretaria de Seguridad Alimentaria y Nutricional (SESAN)
- Centro de Estudios y Promoción del Desarrollo (DESCO)
- Servicio de Medicina PROVIDA
- PRISMA
- Acción Internacional para la Salud (AIS- Perú)
Centro de la Mujer Peruana Flora Tristán
- Centro Andino de Acción Popular (CAAP)
- Fundación Alli Causai
- Instituto Quichwa de Biotecnología Sacha Supay (IQBSS)
- Instituto para la Investigación del Medicamento en los Sistemas de Salud (IFARMA)
- Sisma Mujer
- St. John of God Catholic Hospital (HSJD)
- Royal Integrated Agricultural Project (RIAP)
- Labour Resources Center (LRC)
- Nablus Association For Social & Community Development (NASEEJ)
- Hewar childhood center (HEWAR)
